Analyser vos données ADN brutes à la maison

Dr. Timothy Sexton

DNA alignment written in paper

Ben Casey [CC BY-SA 3.0], via Wikimedia Commons


Étape 1) Téléchargez votre fichier d'ADN autosomique brut et enregistrez-le dans un coffre-fort et lieu sécurisé

Pour analyser vos données ADN, commencez par télécharger votre ADN autosomique brut et enregistrez-le dans un endroit sûr. Voici les instructions pour télécharger votre ADN brut fichier de: 23andMe, ADN d'ascendance, ADN de l'arbre généalogique, Dante Labs, Nous Gène, Mon héritage, Gènes pour de bon, Vitagene, Genera, et Living DNA.


Étape 2) Analysez votre fichier d'ADN brut

>Tous les tests ADN ne ciblent pas les mêmes marqueurs (voir comparaison), mais la plupart des données ADN directes aux consommateurs ciblent plusieurs centaines de milliers d'ADN marqueurs, donc chaque fichier ADN contient beaucoup d'informations pour en savoir plusvous-même. Alors que le fait d'être porteur de certains marqueurs génétiques peut augmenter vos risques d'addictionet d'autres maladies, la connaissance de ces informations vous permettra de planifierpour atténuer ces risques de votre vie.


Utilisez des outils comme Promethease

Promethease est un système de recherche documentaire qui construit un ADN personnel rapport basé sur la mise en relation d'un fichier de génotypes ADN avec le scientifiquerésultats cités dans SNPedia.


Ou recherchez manuellement vos données ADN brutes dans un éditeur de texte à l'aide de la touche 'trouver'une fonction

>Ouvrez le fichier d'ADN brut dans un éditeur de texte et vous remarquerez l'ID SNP unique(rs# ou i#), chromosome, position et génotype. Les formats diffèrent légèrement entre chaque société de test ADN


>Pour évaluer votre risque de dépendance à l'alcool le blog 23andMe vous recommanderegardez ces SNP:

>rs1799971 les allèles A homozygotes (A:A) sont associés à un risque 2x plus élevéd'alcoolisme sévère

>rs1799732 les Insertions homozygotes (I:I) sont associées à un 1.85x supérieurrisque d'alcoolisme sévère


>Pour évaluer votre préférence gustative pour la coriandre, consultez ce SNP:

>rs72921001 les personnes avec l'allèle C (C:C) pensent que la coriandre a le goût du savon


>Pour évaluer votre risque de dépendance à la marijuana, regardez ces SNP:

>rs1057910 l'allèle A entraîne un métabolisme plus rapide du THC, tandis que l'allèle C entraînedans le métabolisme plus lent du THC, il a tendance à prendre plus de temps pour traiter le THC avec plusdans la circulation sanguine et a également tendance à signaler plus de somnolence ou pluseffet intense à partir de la même quantité de THC

>rs324420 l'allèle C est associé à des niveaux inférieurs d'anandamide (plus de FAAH activité), plus d'activation de la dopamine lorsqu'il est exposé à l'odeur du cannabis et pire dormir avec la consommation de cannabis

>rs2023239l'allèle G est associé à plus de fringales et de sevrage, ce la corrélation est très forte lorsqu'il est combiné avec une variante FAAH CC, le G les porteurs d'allèles peuvent avoir une moins bonne mémoire de travail que les AA lorsqu'ils consomment du cannabis

>rs2494732 l'allèle C est associé à un effet plus psychédélique


Étape 3) Comparez votre génotype avec les résultats de la recherche

>Il existe une multitude de ressources décrivant les informations pour chaque SNP y compris dbSNP et SNPedia


dbSNP

> dbSNP contient des variations de nucléotide unique humain, des microsatellites et insertions et suppressions à petite échelle avec publication, population fréquence, conséquence moléculaire et informations de cartographie génomique et RefSeqpour les variations courantes et les mutations cliniques.


SNPpedia

> SNPedia est un wiki qui étudie la génétique humaine. Ils partagent des informations sur les effets des variations de l'ADN, citant des scientifiques évalués par des pairs publications. Il est utilisé par Promethease pour créer un rapport personnel liant vos variations d'ADN aux informations publiées à leur sujet.



>**Si vous êtes préoccupé par tout ce que vous voyez dans vos résultats ADN, s'il vous plaît parlez-en à votre médecin, ou à un conseiller en génétique




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