Gènes pour la résilience au covid-19 : identification des marqueurs ADN correspondants à la résistance au coronavirus et susceptibilité

Le COVID-19 est similaire au syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) dans le respect que les deux virus infecter leurs hôtes humains via le même récepteur, l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (récepteur ACE2), et provoquer des symptômes cliniques et caractéristiques pathologiques. Fait intéressant, la protéine de pointe qui est responsable de la liaison au récepteur est hautement similaire entre 2019-nCoV et SARS-CoV, c'est un résultat de sélection significative pour le même récepteur (Wu., 2020). Recherche sur comment nos corps se défendent contre le SRAS pourraient révéler comment nos corps pourraient se défendre contre covid-19.

Plusieurs récents Genome Wide Les études d'association (GWAS) ont fourni une analyse beaucoup plus approfondie aperçu de les variations génétiques qui peuvent aider à expliquer pourquoi certaines personnes sont virtuellement non affecté par COVID-19, et pour d'autres le virus c'est menaçant la vie ou même mortel.

Dans cet article, nous fournissons une revue de la littérature évaluée par des pairs et présent informations sur les gènes candidats pour Résistance au SARS-CoV. Si vous avez fait un test ADN à domicile comme ceux disponibles chez 23andMe, Ancestry ADN, laboratoires Dante, vous pouvez évaluer vos données ADN brutes et voir comment votre séquence d'ADN se compare à la résultats de recherche.

Comment analyser votre ADN pour la résistance ou la sensibilité aux coronavirus?

Étape 1) Téléchargez votre fichier d'ADN autosomique brut et enregistrez-le dans un coffre-fort et sécurisé lieu

Pour analyser vos données ADN, commencez par téléchargez votre ADN autosomique brut et enregistrez-le dans un endroit sûr. Voici les instructions pour télécharger votre fichier ADN brut de : 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

Étape 2) Analysez votre fichier d'ADN brut

Recherchez vos données ADN brutes à l'aide d'un éditeur de texte tel que "text wrangler" ou "bloc-notes" en utilisant "trouver" ou en utilisant la ligne de commande.

Ouvrez votre fichier d'ADN brut et vous remarquez les en-têtes de l'identifiant SNP unique (rs# ou i#), chromosome, position et génotype. Le les formats diffèrent légèrement entre chaque direct à l'ADN du consommateur société de test.

Pour évaluer votre risque de pauvreté récupération du COVID-19, jetez un œil à ceux-ci Marqueurs ADN décrit ci-dessous :

Plusieurs études d'association à l'échelle du génome (GWAS) ont été récemment publiés qui décrivent lieux associés avec insuffisance respiratoire chez les patients infecté par le SARS-CoV-2 et trois études ont identifié des marqueurs SNP dans le même segment génomique d'environ 50 kb qui est hérité de Néandertaliens (Ellinghaus D et al., 2020, Zeberg & Pääbo, and Blokland et al., 2020). De plus, ces études GWAS ont également identifié un certain nombre d'autres ADN marqueurs qui sont associés au COVID-19, et chaque d'entre eux sont présentés dans le tableau ci-dessous.

De plus, d'autres marqueurs ADN couverts dans cet article incluent rs4804803 qui était associé au SRAS, et ceux positionnés dans l'angiotensine-récepteur de l'enzyme de conversion-2 (ACE2) qui s'est avéré être le même récepteur pour le respiratoire humain coronavirus NL63, , SARS-coronavirus (SRAS-CoV), et le nouveau coronavirus 2019-nCoV/SARS-CoV (Li et autres, 2017 ; Lu et al., 2019). Depuis le pic la protéine du coronavirus a évolué vers correspond à l'ACE2 récepteur, il est probable que les individus avec des variations qui altèrent la protéine la séquence entraînerait un degré de résistance au covid-19. Vous trouverez ci-dessous des SNP non synonymes du Transcription ACE2 NM_021804.2 et de particulier l'intérêt sont les SNP qui provoquent des changements majeurs comme rs199951323 qui entraîne un prématuré codon d'arrêt.